У 1962 р. конструкторське бюро IKL розпочало дослідження з подальшого; розвитку проекту човнів типу 205. Човни нового типу 206 із високоміцної немагнітної сталі призначалися для використання у прибережних водах і відповідали передбаченим для Західної Німеччини договірними зобов’язаннями обмеження тоннажу. На човнах були використані нові схеми забезпечення безпеки екіпажу, а озброєння було розраховане на застосування торпед, що керуються по проводах.
Після того, як остаточно було затверджено проект, у 1966-1968 pp. було проведено виробниче планування, а наступного року було видано перше замовлення на будівництво човнів (загалом на 18 одиниць). До 1975 р. всі човни від U-13 до U-30 перебували у складі флоту. Надалі цей тип був оснащений двома зовнішніми стекпопластиковими контейнерами загальною місткістю 24 хв на додаток до стандартного торпедного озброєння. З 1988 р.12 човнів пройшли модернізацію, що включала встановлення нової електронної апаратури та торпедного озброєння, і отримали нове позначення тип 206А. У 1960-х гг. конструкторське бюро IKL розробило для зовнішнього ринку новий човен типу 209. Підводні човни типу 209, що розроблялися як океанські, через відносно невелику довжину корпусу могли успішно застосовуватися і в прибережних водах. Тип 209 завоював таку популярність, що було побудовано чи замовлено 50 одиниць для зарубіжних партнерів.
Основні модифікації Шість головних варіантів типу 209: початковий 54,3-метровий тип 209/1100 (довжина 178 футів 1 дюйм, водотоннажність надводна 96 т і підводне 1105 т); 56-метровий тип 209/1200 (довжина 183 фута 9 дюймів, водотоннажність надводне 980 т і підводне 1185 т); 59,5-метровий тип 209/1300 2 дюйми, водотоннажність надводна 1000 т і підводна 1285 т); 62-метровий тип 209/1400 (довжина 203 фути 5 дюймів,водотоннажність надводна 1454 т і підводна 1586 т); (довжина 147 футів 7 дюймів, водотоннажність надводна 420 т і підводна 600 т).
Човни закупили такі країни: Греція (чотири типи 209/1100 і чотири типи 209/1200), Аргентина (дві типи 209/1200), Перу (шість типу 209/1200), Колумбія (дві типи 209/1200), Південна Корея (дев’ять типу 209/1200), Туреччина (шість типу 209/1200 та вісім типу 209/1400, більшість з яких було побудовано на турецьких верфях за допомогою Німеччини), Венесуела (дві типу 209/1300), Чилі (дві типи 209/1400), Еквадор (дві типу 209/1300), Індонезія (дві типу 209/1300, ще чотири замовлені, будівництвоостанніх, можливо, не буде реалізовано), Бразилія (п’ять типу 209/1400), Індія (чотири типи 209/1500 та дві у стадії розгляду замовлення). Південна Африка (три типи 209/1400) та Ізраїль (три типи 640). Кожна країна визначала параметри оснащення та чисельність екіпажу залежно від своїх фінансових можливостей.
Під час фолклендської війни підводний човен типу 209/1200 «Сан Луїс» (San Luis) ВМС Аргентини тричі безуспішно проводила торпедні атаки проти кораблів британського оперативного з’єднання, але виявила свою присутність, що змусило командування угруповання ВМС Великої Британії. авіацію для її пошуку.